2)鲤形目Cypriniformes
为鱼类中最大目之一。体表被圆鳞或裸露，头部无鳞；有中喙骨弧，下咽骨呈镰状，脊椎的最前四枚常愈结，且两侧附有4对鳔骨（带状骨，舟状骨、间插骨及三脚骨等）构成韦伯氏器连接鳔的前端和内耳，有保持鱼体平衡的作用：背鳍1个，腹鳍腹位，鳍多无硬棘，即使有也是没有超过3根的假棘。目前已发现本目有5千种以上，多分布在温带和热带淡水域，只有2科为海产，我国约有600种。药用价值较高的有鲤科、鲇科、鳅科，胡子鲶科、鮡科，鮠科等。
（A）鲤科Cyprinidae：体侧扁，呈棱形，体表多被圆鳞，头不被鳞；唇须1～2对或不存在，上、下颔无齿，特有咽齿1～3行，至多不超过8个；下颌骨形大而呈镰形；无脂鳍。分布在世界各地淡水中。本科占鲤形目总数的70％～80%，现有2千多种，隶属200多属，我国有100多属500种左右，可供药用的有青鱼Mylopharyngodonpiceus（Rich）、草鱼Ctenopharyngodonidellus(CuvieretValenciennes）、bu鱼AcanthorhodeuselongatusRegan、白鱼Anabariliusalburnops（Regan）、金线鱼（小鲈鲤）Sinocyclocheilusgrahami（Regan）、倒刺鲃Barbosdenticulatusdenticulatus（Oshima）等。
(B)鲇（鲶）科Siluridae：体粘滑无鳞，表面裸出或具骨板；有须4～6条；口大，两颌有利齿，下咽骨正常具细齿；鳃盖下骨不存在；无脂鳍，背鳍甚小或缺，无棘；臀鳍大而长，分枝的鳍条约50～85，尾鳍亦小。本种分2属，普遍分布在我国各地，为食肉性底层鱼。可入药的有鲶鱼Parasilurusasotus（Linnaeus）等。
（C）胡子鲶科Clariidae：主要特征与鲶科相同，但背鳍甚长，有8条须。主产热带和亚热带地区，尤以非洲的种类最多，我国分布1属两种。如胡子鲶Clariasfuscus（Lacepede）可供药用。
（D）鳅科Cobitidae：体呈筒状，鳞细或退化，上颌边缘仅由前颌骨形成，咽喉齿1排，齿数常较多，有6至8或更多的须，其中常有一或两对吻须，一或两对颌须，还常有鼻须或颐须。胸鳍与腹鳍均不向左右平展。鳔形小，外包以骨质壳。本科鱼的最大耳石在椭圆囊中。本科共分3个亚科10余属50多种。常作药用的有泥鳅Misgurnusanguillicaudatus（Cantor）、大鳞泥鳅M.mizo1epis（Gunther）、滇泥鳅M.mohoityyunnanNichols等。
（E）鮡科Sisoridae：本科鱼类的两鼻孔很靠近，共有须8枚，鼻须生在两鼻孔之间，颌须的基部有皮片连吻部，故基部甚宽。鳃孔在下方两边相距很远。脂鳍存在，有时可发展为有鳍条的第2脊鳍。多分布在我国南方山谷溪流之中。共分4属。可供入药的有藏鮡Glyptosternonmaculatus（Regan）。
（F）鮠科Bagridae：鮠科鱼类有2个背鳍，第1个前背鳍短，有锯齿状的棘，第2个为脂鳍。鳃膜与峡部相连。有须4对，1对鼻须，1对颌须及2对颐须。我国有6属50多种，各地均可见到，为最普通的一类。可入药的有中臀黄颡鱼Pseudobagrusmebianalis(Regan）。
3)鳗鲡目Angviliformes本目鱼类体形圆而长。一般无腹鳍，背、尾、臀三种鳍连为一体不能区分，鳞极细或退化。脊椎骨数目甚多，最多可达260枚。本目分2亚目25科，有100多种。我国主产在南海。常见药用的有以下3科。
（A）鳗鲡科Anguillidae：头部圆锥形，体有鳞退化后埋于皮中，排成斜行。鳃盖骨发达，鳃孔显著。舌明显。齿针状。胸鳍发达。本科有1属3种，主产在温热带海域。入药的有鳗鲡AnguillajaponicaTemmincketSchlege1、花鳗A.MarmorataQuoyetGamard等。
（B）海鳝科Muraenidae：本科鱼均无鳞。体长或很长（身长可达体高的40～50倍）无舌。鳃孔小，呈圆形或水平裂缝样。无胸鳍。为温热带珊瑚丛、洞中生活的近海浅水鱼类。本科分6～7属，有60～70种。可入药的有网纹裸胸鳝G.ymnothoraxreticularis（Bloch）、斑条裸胸鳝G.punctatafosciata（Bleeker）、斑点裸胸鳝G.meleagris（Shaw）、花斑裸胸鳝C.pictusAh1．、波斑裸胸鳝G.undulatus（Lacepede）等。
（C）海鳗科Muraenesoceidae：体长，无鳞，前部近圆而后部侧扁，尾部与体躯几乎等长或稍短。心脏近在鳃后。头长眼大，鳃孔显著，鳃盖发达。舌形狭，尖端稍游离。犁齿形大，无侧线。本科仅有1属3种。广布于东南亚一带，为凶猛底层海中肉食性鱼类。例如灰海鳗Muraenesoxcinereus（Forsk）。
4)海龙目Syngnathiformes
口前位，口裂上缘仅由前颌骨或前颌骨与颌骨共同组成管状吻。无颅顶骨和后耳骨。咽骨退化。鳃常呈簇状。脊鳍、臀鳍及胸鳍均不分枝，只有腹鳍与尾鳍部分分枝，若有第1脊鳍存在必为刺鳍，腹鳍如存在必为腹位或前腹位。雄性腹部有由皮褶形成的育卵袋。本目为体形特殊的小型海鱼。仅介绍供药用的海龙科。
海龙科Syngnathidae：全体被膜质骨片。鳃呈丛簇圆叶状。脊鳍1个，全由软条组成，无腹鳍。尾细长，适于卷附在海藻上。肾小管及尿管均在体腔的右侧，随右主静脉而行。本科分10余属，广布于世界各处，我国产有9属。本科鱼类无食用价值，但为名贵中药，例如粗吻海龙Trachyrhamphusserratus（TemmincketSchlegel）、刁海龙Solenognathush ardwickii（Gray）、拟海龙Syngnathoidesbiaculeatus（Bloch）、刺海马 HippocampushistrixKaup.等。
5)鲈形目Perciformes无鳔管。鳞片多为栉鳞。鳍有棘，背鳍通常由鳍棘和鳍条两部分组成。腹鳍多为胸位，也有喉位，多为1鳍棘5鳍条。口先端常呈斜裂状，锐齿着生在颌骨、犁骨和腭骨上形成齿带。鳃盖发达。本科为硬骨鱼系中最大的一目，有8千多种，我国产并入药的常见以下7科。
（A）鮨科Serranidae：全体（连头部）被鳞，鳞片表面稍粗糙，犹如毡毛一样。侧线完全。下咽骨不结合，上颌骨不被眼前骨所覆着。犁骨与腭骨通常具齿。胸鳍的鳍条大都相似而多分歧。背鳍单个，其软鳍部臀鳍较长，臀棘3。我国有18属63种，多产于温热带海域。入药的有鲈鱼Lateo1abraxjaponicus（CuvieretValenciennes）。
（B）石首鱼科Sciaenidae：上颌骨多少被眼前骨所覆着，下颌不具触须。或间有1单独短须。下咽骨不结合。腭通常无齿。胸鳍或具腋鳞。本科有13属37种，是我国最重要的经济鱼类。可供入药的有大黄鱼Pseudosciaenacrocea（Richardson）、黄姑鱼 Nibeaalbeflora（Richardson）、鮸鱼Miichthysmiiuy（Basilewsky）等。
（C）鲾科Leiognathidae：本科鱼类身体方长而隆起，多少侧扁，体被圆鳞。前颌骨具有强度延伸性，当完全伸出时成一水平、向上或向下的管。我国有4属20种。人药的有黄斑鲾Leiognathusbindus(CuvieretValenciennes）等。
（D）石鲈科Pomadasyidae：体形方长而侧扁。被中或小形栉鳞，眼前有鳞。侧线完全，线上鳞片较小。两颌长短相差不多，稍能伸缩，上下颌具分离齿，侧齿不作臼齿状。鳃盖骨不具刺。背鳍不呈深凹状，或具硬长而扁平的棘，臀鳍棘3，第2棘最长。本科为生长在热带或亚热带的中型肉食鱼类，我国有5属21种。可入药的有纵带髭鲷HapalogenysrishinouyeiSmithetpope.、横髭鲷H.mucronatus(EydouxetSouleyet)等。
（E）金线鱼科Scatophagidae:体形侧扁菱形。全体（包括头、脊鳍、臀鳍的鳍条部）均被细小的栉鳞，仅眼前无鳍。侧线完全而隆起，依背部的外廓向后行。头小，口小，前位，不能伸缩。有1属9种，广布于印度洋、平洋及各大河口中。可药用的如金线鱼Scatophagidusargus(Linn)。
（F）带鱼科Trichiuridae：体形扁长如带故名。脊椎骨100以上。背鳍与臀鳍很长，并彼此连续看不出分界，腹鳍退化或不存在。无尾鳍。牙齿锐长。我国有2属4种，分布在暖海域，是我国最重要的经济鱼类之一。能入药的有带鱼Trichiurushaumela（Forskal）、小带鱼T.multicusGray.、沙带鱼T.savala（GuvieretValenciennes）等。
(G)鲭科Scombridae：体呈梭形而稍侧扁。被细小圆鳞。脂脸发达。两颌上的牙齿细弱。舌小而光滑。脊鳍两个，彼此分离很远，鳍条低于刺部。臀鳍与鳍条相似而相对。尾鳍深叉，尾柄上有上下两条较小的棱。本科有2属2种，例如鲐鱼PneumatophorusjaponicusHouttuyn.，可人药亦能食用。6）鳢形目Ophicoephaliformes体被圆鳞。颌舌弓与第1鳃弓的上鳃骨形成褶鳃呼吸器，副鳃腔及咽喉分布有很多微血管，也可进行呼吸。鳃很长，无鳔管。鳍无棘。若有腹鳍则为前腹位。本目仅一鳍科Ophicephalidae。其中乌鳢（乌鱼）OphicephalusargusCantor。既可人药亦可食用。
7）魨形目Tetraodontiformes本目鱼类颌骨与头骨固结。鳃孔小，鳃腔上无气室。体表裸出，或被粗鳞，硬盾或密生硬刺。前背脊不具吸盘。腹鳍左右不相并。有侧线。尾鳞形状不一。全世界有200多种，我国产60多种。通常分布于温带及热带的海域或河里。
（A）兰子鱼科Siganidae：体方长而侧扁。被很细小的薄圆鳞。侧线完全而简单。口小，前位，不能伸缩。腹鳍具外棘与内棘各一。尾柄形细而稍圆。为印度洋、太平洋的暖水区域的食草鱼类。我国产1属10种。入药的有黄斑兰子鱼Siganusaramin（BlochetSchneider）。
（B）三刺鲀科Triacanthidae：体侧扁，多少被细小而粗糙的鳞，鳞上多少有小刺。口小。各颌齿排列成2列，前列齿呈门齿状，后列齿稍圆。腰带不具活动性。背鳍棘部具3棘。可供入药的有短吻三刺鲀TriacanthusbrevirostrisTemmincketSchlege1．、尖吻三刺鲀T.strigiliferCantor等。
(C）鲀科（河鲀科）Tetraodontidae：体圆形，有时很宽。裸露无鳞，光滑或有小刺，体躯能鼓气膨胀如球。两颌齿愈合成一片，中央有一缝。鳃孔小，紧位于胸鳍的前方。鼻孔形状特殊。胸鳍短宽。尾鳍明显。本科鱼类大多有毒，特别是产卵期中，其毒多含在肝脏与卵巢中，可致人死亡。能药用的有黑免头鲀Lagocephalusinermis(TemmincketSchlegel)、大眼免头鲀L.lunaris(BlochetSchneider)、棕斑免头鲀L.lunacisspddiceus(richordson)、虫纹东方魨Fuguvernicularis(TemmincketSchlege)等。
（D）刺鲀科Diodontidae：体宽而短，背部平扁。腹部能鼓气。全身除唇部和尾柄外，被有长刺而得名。上下颌骨齿板成鸟喙状。背鳍不具棘部。为生活在炎热浅海水草和珊瑚礁的鱼类。供药用的有九斑刺魨DiodonnovemaculatusBleeker.、刺额短刺鲀Chilomycterusechinatus（Gronow）等。
（E）翻车鲀科Molidae：体短而侧扁，后部平直，被皮质。体躯不能膨胀。口很小，前位。齿愈合成齿板，无中缝。背鳍与臀鳍甚高。无尾柄。为大海中飘流生活的鱼类。供药用的有翻车魨Molamola（Linnaeus）、矛尾翻车魨Masturuslanceolatus（Lienard）等。
8）蝶形目Pleuronectiformes成鱼体侧扁，左右不对称。被小圆鳞或栉鳞。两眼位于头部的一侧。有眼的一侧有色素。头骨不对称。背鳍与臀鳍的基底均长，一般无棘。腹鳍胸部或喉位，鳍条通常不超过6枚。成鱼无鳔。为近海的浅水鱼类，少数进入淡水域，全身平卧状营底栖生活。可入药的有牙鲆Paralichtysolivacus（TemmincketSchlegel）、马来斑鲆PseudorhombusmalayanusBleeker等。
9）海蛾鱼目Pegasiformes：体形似蛾而得名。体表被骨板。前鼻骨前部合并成一突起而呈齿状的吻部。后颞颥骨和头骨愈合。鳃呈梳状。胸鳍发达作水平状，有10～18枚不分支的鳍条，鳍条下部坚硬如刺，但末端软而分节。脊椎骨19～24枚，其中最前端的6枚固结不能活动，无肋骨。无鳔。为海滨小型鱼类。本目只有1科，其中能入药的有长海蛾PegasusnatansLinne。、龙海蛾P.draconisLinne。、飞海蛾P.volausLinne。、海蛾鱼P.laternariusCuvier。等。
10)灯笼鱼目Scopeliformes本目似鲱形目，但口裂上缘仅由前颌骨组成。无中鸟喙骨。眼楔骨或有或无。脂鳍常存。腹鳍腹位，有时移至胸鳍之下。但腰骨块不与肩弧相连。发光器有或无。鳔若存在必有管。能入药的有大头狗母鱼Trachinocephalusmyops（BlochetSchneider）、多齿蛇鲻sauridatumbil（BlochetSchneider）、花斑蛇鲻S．undosquamis（Richardson）、长条蛇鲻S.filamentosaOgilby.、长蛇鲻S．elongata（TemmincketSchlegel）等。
11)合鳃目Symbranchiformes体形似鳗，光滑无鳞。鳃常退化，鳃裂移至头部腹面，左右两鳃孔连接在一起形成一横缝，故称合鳃目。无鳔。奇鳍变为皮褶。口裂上緣由前颌骨组成。例如黄鳝Monopterusalba(Zuiew),既能入药，也可食用。