约有人类基因组的99%被称作垃圾DNA, 他们不作为基因表达. 低等动物(拟南芥11%, 线虫7%, 果蝇3%)的垃圾DNA相对较少且在全基因组中平均分布, 人类基因在广大的垃圾DNA中离散为几个小组. 估计有一个控制基因物理聚集形态的机能, 但迄今为止未被发现.
在重复序列中最常见的是Alu, 大约占10%. 通常重复序列含有大量AT碱基和相对较少GC碱基. 端粒(telomeres)或 着丝点(centromeres)中的其他重复序列被认为参与了染色体保护和细胞分裂. 端粒在细胞分裂中变短, 相对较短的端粒组织细胞分裂, 这可能跟衰老有关. 癌细胞有阻止端粒变短的机能, 所以细胞能无限复制. 世界上第一个成年哺乳动物克隆体多莉(Dolly)的衰老被饶有兴致的关注, 因为她是从母体细胞克隆而来, 端粒已经变短.
 
 端粒和着丝点
<http://www.esb.utexas.edu/dr325/genweb>
<www.biokurs.de/skripten>
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